مراکز علمی پژوهشکده شهید صدر شامل سه مرکز به شرح زیر است:
1- مرکز مطالعات راهبردی نظام سازی اسلامی
مرکزی پژوهشی و آموزشی است که در راستای اصلاح نظام های فرهنگی-اجتماعی از طریق طراحی و پیگیری الگوهای مطلوب و ایده های پیشران این حوزه عمل می‌کند.
2- مرکز مطالعات بنیادین علم و تمدن اسلامی
مرکزی پژوهشی و آموزشی است که با واکاوی اندیشه های دینی، غربی و ایرانی در حوزه بنیادهای فکری، در نظر دارد به مفاهیم بنیادین مشترکی درحوزه تمدن سازی دست یابد؛ حوزه هایی چون انسان شناسی، تمدن شناسی، ایران شناسی، تاریخ شناسی، نظام شناسی، ارزش شناسی و مطالعات حکمرانی (تربیت زمامدار)، طرح های جاری این مرکز است.
3- مرکز مطالعات آمریکا
مرکزی پژوهشی و آموزشی به منظور شناخت آمریکا به عنوان مهمترین رقیب تمدنی اسلام و دشمن انقلاب اسلامی، ارائه راهکار برای مقابله با تهدیدات آمریکا و همچنین تسریع در افول آمریکا، تولید و ارائه سیاست های لازم به دستگاه های ذیربط در کشور می‌باشد.
| 
